【VASP/ML】npj Comput. Mater.:機器學習精準預測氧化還原電位 2024年7月22日 上午10:28 ? 頂刊 ? 閱讀 30 研究背景 基于電子轉(zhuǎn)移(ET)的氧化還原電位(Ox+ne?→Red)是各種電化學能量轉(zhuǎn)換設備的基本原理之一,它決定了氧化還原能級相對于金屬材料中費米能級的位置(或半導體和絕緣體材料的價帶最大值(VBM)和導帶最小值(CBM))。此外,氧化還原電位還能確定溶液中離子和分子的穩(wěn)定窗口,即特定離子或分子可發(fā)生電化學反應的電壓范圍。然而,想要對氧化還原電位實現(xiàn)精確的第一性原理(FP)預測,就必須平衡雜化函數(shù)高昂的計算成本和近似求解(連續(xù)介質(zhì)溶解模型和QM/MM模型)導致的誤差。 近期,日本株式會社豐田中央研究所Ryosuke Jinnouchi等人出了一種結合第一性原理計算和機器學習的方法,從機器學習力場到半局域泛函,再到雜化泛函的熱力學積分,最終利用Δ-機器學習(Δ-ML)逐步完善電子轉(zhuǎn)移自由能的計算,在僅使用25%雜化函數(shù)(PBE0)的情況下,成功預測實驗報道的Fe3+/Fe2+、Cu2+/Cu+、Ag2+/Ag+的氧化還原電位(三種材料分別代表較大、較小的電位和復雜的配位環(huán)境)。 研究亮點 1、低成本高精度預測:Δ-ML輔助模型預測的氧化還原電位的均方根誤差降低了一個數(shù)量級以上,預測偏差明顯減小到10 mV以下,并成功預測出Fe3+/Fe2+、Cu2+/Cu+、Ag2+/Ag+的氧化還原電位分別為0.92、0.26和1.99 V。 2、理論研究新范式:通過機器學習力場和雜化泛函的精確調(diào)控,實現(xiàn)預測結果的不斷優(yōu)化。作者提出在不同環(huán)境下,選擇不同的參考能級(O 1s能級)能夠拓寬模型的應用范圍。 計算方法 含有氧化還原物質(zhì)的溶液按圖1所示進行建模。水分子數(shù)分別設置為32、64和96,以明確體系的尺寸效應,其中,水的密度設定為0.99 g cm-3。 針對FP計算,作者利用VASP軟件開展研究,使用投影綴加平面波(PAW)方法描述電子-離子相互作用。對于含有32個水分子的體系,作者使用2×2×2 k點網(wǎng)格,其余模型采用Γ點網(wǎng)格。計算中,截斷能被設置為520 eV,并對銅的兩種原子構型(3d104p1和3p63d104p1)進行了比較,以考察半核電子弛豫對氧化還原電位的影響。 機器學習采用VASP.6.3中的集成模塊開展,針對每種還原態(tài)和氧化態(tài),作者都構建了MLFF和Δ-ML模型。所有MLFF模型都是利用作者開發(fā)的主動學習算法在400 K下生成的。 圖文導讀 電子的化學勢計算需要通過FP所使用的真空能級進行確定,考慮到周期體系下真空能級難以直接獲取,作者使用相對于真空能級固定的H2O中O 1s能級作為參考能級,具體方法示意圖如圖1a所示。由于O 1s能級距離氧化還原物種足夠遠,不受反應物的影響,且與平均局部電位成比例。因此,以O 1s為參考來測量氧化還原水平的結果是<U1-U0>λ/n-<ε1s, bulk>,其中U0和U1分別是氧化態(tài)和還原態(tài)的勢能,μ和n是化學勢和參與反應的電子數(shù)(圖1c),進而真空能級可以表述為μ-<ε1s, bulk>(圖1b)。 圖1 參考能級的選擇 在確定參考能級之后,為解決雜化函數(shù)計算電子轉(zhuǎn)移自由能差值成本較大的問題,作者提出了圖2所示的ML輔助方法。作者使用非局域雜化泛函(FPnl(Ox/Red))、半局域泛函(FPsl(Ox/Red))和機器學習力場(ML(Ox/Red))對氧化和還原情況進行的計算。最開始,作者認為可以使用ML模型來進行熱力學積分(TI),但計算得出的精度偏差巨大。而FPsl方法是對氧化態(tài)和還原態(tài)利用ML電位到FP電位進行熱力學積分來校正ML電位預測的誤差,這種積分法具有如下優(yōu)勢:考慮了TI中的大部分非線性成分,可以達到極高的統(tǒng)計精度;還為其他計算步驟提供了所需的均衡初始結構;實現(xiàn)只需幾十皮秒的分子動力學模擬(MD)就能收斂。此外,對FPnl方法計算出的電位,作者決定應用Δ-ML學習FPsl電位和FPnl電位之間的差值ΔU。由于FPsl函數(shù)和FPnl函數(shù)之間的能量差值非常平滑,因此只需進行幾十次FPnl計算,就可以學習到非常精確的ΔU,與機器學習力場(MLFF)相比,誤差明顯縮小了一個數(shù)量級。 綜上所述,作者基于Δ-ML模型的精確性,在不同F(xiàn)P方法之間獲得極其精確的自由能差,而無需進一步修正,使用FPsl方法生成不同配位環(huán)境,使用FPnl方法直接將TI所需的計算時間從2000萬核小時減少到16800核小時。 圖2 不同機器學習方法的對比 按照上述計算流程,圖3顯示了用MLFF和FPsl方法計算的還原態(tài)和氧化態(tài)的金屬氧徑向分布函數(shù)(RDF)和連續(xù)積分配位數(shù)(RIN)。MLFF很好地再現(xiàn)了FPsl方法的RDF和RIN。兩種方法都表明,鐵離子的配位數(shù)為6,與電荷狀態(tài)無關。相反,銅的配位數(shù)從氧化態(tài)的5-6個(Cu2+)變?yōu)檫€原態(tài)的2-3個(Cu+)。銀的配位數(shù)也從氧化態(tài)的5-6個(Ag2+)變?yōu)檫€原態(tài)的4-5個(Ag+)。這些水合結構與之前使用FP-MD方法和經(jīng)驗力場進行的MD研究一致。雖然RDF中的Fe-O距離以及Cu-O和Ag-O的拐點略有偏差,這可能與FP-MD模擬時間較短以及MLFF自身誤差有關,但總體而言,作者提出的流程在較低的成本和時間下很好地再現(xiàn)了水合金屬陽離子的第一性原理能量和結構。 圖3 計算金屬的還原態(tài)和氧化態(tài) 作者在使用含有32、64和96個水分子的超胞中驗證了FPsl預測氧化還原電位的精確性之后。作者對超胞中含有的64個水分子的溶液進行了計算,計算得出的氧化還原電位與實驗結果的比較見圖4。在FPsl上訓練的MLFF與沒有任何MLFF輔助的FPsl計算值(FPsl w/o ML)相比,會產(chǎn)生30-250 mV的偏差,同時,作者證實了這種偏差取決于訓練數(shù)據(jù)的大小。如FPsl w/ ML所示,這些偏差可以通過兩次TI積分(圖2中的ML(Ox)→FPsl(Ox)和ML(Red)→FPsl(Red))來糾正。然而,半局域泛函導致了相當大的非系統(tǒng)誤差,與實驗結果相比,銀的氧化還原電位被低估,而銅的氧化還原電位則被明顯高估。 圖4 不同方法預測結果對比 最后,研究表明,使用25%雜化泛函,平均誤差可降低到0.11 V。如表1所示,Cu2+/Cu+的氧化還原電位隨著雜化泛函的增加而降低,而Ag2+/Ag+的氧化還原電位則隨著分數(shù)的增加而升高。至于Fe3+/Fe2+趨勢則不太明顯(先上升后略有下降)。Fe3+/Fe2+、Cu2+/Cu+、Ag2+/Ag+的氧化還原電位分別為0.92、0.26和1.99 V,與實驗報道的0.77、0.15、1.98 V十分貼切。 表1 不同比例雜化泛函的預測結果 文獻信息 Jinnouchi, R., Karsai, F., & Kresse, G. (2024). Machine learning-aided first-principles calculations of redox potentials. npj Computational Materials, 10(1), 107. https://doi.org/10.1038/s41524-024-01295-6 原創(chuàng)文章,作者:計算搬磚工程師,如若轉(zhuǎn)載,請注明來源華算科技,注明出處:http://www.xiubac.cn/index.php/2024/07/22/db8f1d7df4/ 贊 (0) 0 生成海報 相關推薦 華科,最新Nature Chemistry!重大發(fā)現(xiàn)! 2024年5月6日 ?Nano Letters:BiVO4粒子光催化劑中助催化劑/半導體界面電荷轉(zhuǎn)移的納米級測量 2022年12月7日 復旦大學王永剛Angew:n/p型吩噻嗪有機支架的分子定制助力鋅電池 2023年11月2日 陸俊/張山青EES: 鋰離子電池及其他可持續(xù)回收利用的智能輔助預設計 2023年10月23日 汪國秀團隊,最新Angew! 2024年4月27日 ?南開陳軍Angew:不對稱溶劑調(diào)節(jié)結晶限制的電解質(zhì)實現(xiàn)全氣候鋰金屬電池 2024年2月3日